Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TesP47226 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TesP47226 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TesP47226 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms