Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept1P42209 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms