Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ThpoP40226 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ThpoP40226 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms