Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab5cP35278 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rab5cP35278 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms