Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnd3P30282 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnd3P30282 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms