Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxrgP28705 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxrgP28705 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RxrgP28705 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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