Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PdgfraP26618 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms