Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tsta3P23591 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tsta3P23591 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms