Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxd8P23463 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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