Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ggta1P23336 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms