Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PrkchP23298 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PrkchP23298 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms