Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpm3P21107 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm3P21107 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm3P21107 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm3P21107 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms