Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fcer1aP20489 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fcer1aP20489 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms