Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms