Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VimP20152 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VimP20152 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VimP20152 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VimP20152 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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