Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P20040 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P20040 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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