Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NelfeP19426 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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NelfeP19426 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NelfeP19426 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms