Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hoxb1P17919 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxb1P17919 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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