Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sptan1P16546 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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