Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DmdP11531 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DmdP11531 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
DmdP11531 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DmdP11531 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DmdP11531 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DmdP11531 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DmdP11531 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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DmdP11531 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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DmdP11531 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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DmdP11531 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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DmdP11531 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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DmdP11531 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DmdP11531 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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DmdP11531 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
DmdP11531 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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