Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RaraP11416 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RaraP11416 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RaraP11416 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RaraP11416 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RaraP11416 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RaraP11416 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RaraP11416 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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