Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lire1P11260 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lire1P11260 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lire1P11260 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lire1P11260 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lire1P11260 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lire1P11260 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lire1P11260 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lire1P11260 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms