Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P10404 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P10404 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P10404 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P10404 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P10404 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P10404 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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