Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ndufb1P0DN34 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms