Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Surf1P09925 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms