Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Spta1P08032 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms