Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TtrP07309 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms