Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PdgfrbP05622 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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