Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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H2-Eb1P04230 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-Eb1P04230 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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