Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01790 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01790 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01790 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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