Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01648 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01648 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01648 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01648 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P01648 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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