Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DcxO88809 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DcxO88809 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DcxO88809 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms