Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Slc6a20bO88575 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20bO88575 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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