Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfdp1O88271 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfdp1O88271 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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