Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp4O70480 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms