Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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