Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trdmt1O55055 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdmt1O55055 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdmt1O55055 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trdmt1O55055 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdmt1O55055 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trdmt1O55055 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trdmt1O55055 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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