Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn5O54942 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn5O54942 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn5O54942 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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