Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
E2f6O54917 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
E2f6O54917 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms