Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChkaO54804 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ChkaO54804 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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