Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab33bO35963 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms