Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stag2O35638 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms