Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk2O35491 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk2O35491 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clk2O35491 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk2O35491 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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