Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms