Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms