Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LfngO09010 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LfngO09010 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
LfngO09010 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LfngO09010 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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