Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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MttpO08601 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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MttpO08601 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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MttpO08601 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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MttpO08601 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MttpO08601 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MttpO08601 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MttpO08601 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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MttpO08601 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MttpO08601 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms