Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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