Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm20918J3QN17 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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