Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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